直接在纯水系统中进行在线TOC值测定，可以对实验分析提供独特的保证及品质控制。一般来说，比起离子污染物，有机污染物更不容易被纯化介质(purificationmedia)“吸附”(图3)，而更容易漏过(break-through)。总有机碳的测定因此仅凭电阻率值(电导率)无法了解水中的有机物含量是否增加、是否产生变动或是过高。TOC值的测定可及早预警有机物的污染，从而避免使用有机物含量过高的纯水。其他的优点还包括：符合规范标准(USP,BP,GLP)试剂及液体产品的品质控制找出最适当的分析方法(测定的极限，保留时间，纯化柱的使用期限解决分析方法上的问题在线TOC测定提供超纯水系统必要的监控及保养方式。利用TOC测量技术，可以使实验室在进行对于有机物具有高敏感性的分析时，能有更好的控制方法。